Le Canal de Suez s'étend entre le port de Port-Saïd sur la Méditerranée au nord jusqu'au port de Suez sur le golfe de Suez au sud, où la nature des sols de cette zone se varie d'un sol argileux au nord à un sol rocheux au sud. Depuis des millénaires, de limon et de boue s'accumulent à Port-Saïd et dans ses environs et se mélangent avec l'eau du Nil et à travers la Damiette. Cette structure de sol argileux s'étend jusqu'à la ville de Qantara, à 40 km au sud de Port-Saïd, où se mélangent limon et sable. Le sol du secteur central du Canal dans la région située entre Qantara et Kabrit se forme d'un mélange de sable fin et grossier. Alors que le sol du secteur sud se constitue de couches de roches sableuses et calcaires.
Le Canal de Suez se situe au niveau de la mer qui se change légèrement. La hauteur de la marée au nord est d'environ 65 cm et cela provoque des courants marins entre la Méditerranée et le lac Timsah. La hauteur de la marée au sud est d'environ 1,9 mètre et cela provoque des courants marins entre le golfe de Suez et les lacs Amers.
Les côtés du Canal sont recouverts de revêtements de pierre et de rideaux de fer dont la conception se varie selon la nature du region afin de le protéger de l'effondrement causée par la pression des vagues résultant du transit des navires dans le Canal de Suez.
Des bornes d'amarrage s'étendent tout au long des côtés du Canal tous les 125 mètres pour l'amarrage des navires en cas d'urgence. Il existe également des signes kilométriques tout au long du Canal pour aider les navires à se localiser dans la voie navigable. La voie navigable se détermine par des bouées équipées d'un réflecteur radar et d'un éclairage nocturne.
La pente latérale de la section transversale du Canal se varie selon la nature du sol, où le rapport est de 4:1 au nord et de 3:1 au sud.